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實驗室儀器
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植物材料RNA的3種提取方法
[2013/9/22]
實驗步驟
1. 利用RNeasy Plant Mini Kit提取總RNA
1. 于1.5 ml離心管中加入0.5 ml RLT緩沖液和5ul β-巰基乙醇;
2. 稱取約100 mg材料,液氮研磨后轉(zhuǎn)移到提取液中,渦旋混勻,56℃,2 min;
3. 加入紫色柱子,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
4.濾液轉(zhuǎn)入一新的1.5 ml離心管中,加入1/2體積的無水乙醇,用槍頭混勻,移入粉色柱子,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
5. 棄濾液,加入700 ul RW 1,23℃,12000 rpm,離心15 sec;
6. 將柱子移入一新的2 ml收集管,加入500 ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
7. 棄濾液,加入500ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
8. 加20 ul DEPC處理過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm,離心1 min;
9. 再分別加入40 ul和20ul DEPC處理過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm離心1 min;
10. 合并三次收集的RNA,取2ul電泳檢測純度和質(zhì)量。-20℃短時間保存,或-80℃長期保存。
2. 利用TRIZOL試劑盒提取RNA
1. 于1.5 ml離心管中加入1 ml TRIZOL提取液;
2. 稱取約100 mg液氮研磨后的材料,轉(zhuǎn)移到提取液中,混勻,2-8℃,≤12000 g離心10-15 min;
3. 取上清,于15-30℃放置5min,加0.2 ml氯仿,劇烈搖動15 sec, 15-30℃放置2-3min,2-80C, ≤12000 g,離心15 min;
4. 取水相,加等體積異丙醇,15-30℃放置10 min,2-8℃,<12000 g,離心10 min;
5. 用75%乙醇洗滌沉淀,2-8℃,<7500g離心5 min;用DEPC處理的水溶解RNA,-20℃短時間保存,或-80℃長期保存。
3. CTAB法提取植物總RNA
1. 50 ml離心管中加入15 ml CTAB提取緩沖液(需加入300ul β-巰基乙醇),65℃預(yù)熱;
2. 稱2-3 g新鮮的植物材料,在液氮中充分研磨成粉末;
3. 樣品轉(zhuǎn)入50 ml離心管中,迅速震蕩混勻至無成團結(jié)塊,65℃溫浴10 min,再加入15 ml氯仿,混勻;
4. 室溫下,10000 rpm,離心15 min,上層水相移入一個新的離心管,加入等體積的氯仿,混勻后再抽提一次;
5. 將上層水相轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入 8M的LiCl,使終濃度為2M(約加入水相的 1/3),4℃,過夜;
6. 4℃,12000 rpm,離心20 min沉淀RNA棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀,晾干;
7. 加入500ul SSTE溶解沉淀,轉(zhuǎn)移至1.5 ml離心管中,加入等體積酸性酚/氯仿后混勻;
8. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,將上層水相轉(zhuǎn)移至另一1.5 ml離心管中,加入等體積的氯仿后混勻;
9. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,上層水相轉(zhuǎn)移至新管中,加入1/10體積的3M NaAC和2倍體積無水乙醇,-80℃靜置30 min;
10. 4℃,13000 rpm,離心20 min,70%乙醇洗滌沉淀,烘干后加入50 ul DEPC處理H20溶解RNA,取1ul電泳檢測,-80℃保存?zhèn)溆谩?
4. RNA的純化
1. DEPC水處理的1.5 ml離心管中加入:45ul RNA,7.5ul l0XDnase Assay Buffer,20U RNase inhibitor 1.5ul Dnase I,混合液于37℃溫浴30 min;
2. 用DEPC-H20將溶液體積調(diào)至250ul,加1/10體積的3 M NaAC(pH 5.2)和2倍體積冷的無水乙醇,混勻,-20℃放置30 min;
3. 4℃,12000 rpm,離心20 min,沉淀RNA;
4. -20℃預(yù)冷的70%乙醇洗一次,-20℃預(yù)冷的100%乙醇洗一次;
5. 干燥后,用20 ul DEPC處理的H2O溶解,-20℃保存。
1. 利用RNeasy Plant Mini Kit提取總RNA
1. 于1.5 ml離心管中加入0.5 ml RLT緩沖液和5ul β-巰基乙醇;
2. 稱取約100 mg材料,液氮研磨后轉(zhuǎn)移到提取液中,渦旋混勻,56℃,2 min;
3. 加入紫色柱子,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
4.濾液轉(zhuǎn)入一新的1.5 ml離心管中,加入1/2體積的無水乙醇,用槍頭混勻,移入粉色柱子,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
5. 棄濾液,加入700 ul RW 1,23℃,12000 rpm,離心15 sec;
6. 將柱子移入一新的2 ml收集管,加入500 ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
7. 棄濾液,加入500ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
8. 加20 ul DEPC處理過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm,離心1 min;
9. 再分別加入40 ul和20ul DEPC處理過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm離心1 min;
10. 合并三次收集的RNA,取2ul電泳檢測純度和質(zhì)量。-20℃短時間保存,或-80℃長期保存。
2. 利用TRIZOL試劑盒提取RNA
1. 于1.5 ml離心管中加入1 ml TRIZOL提取液;
2. 稱取約100 mg液氮研磨后的材料,轉(zhuǎn)移到提取液中,混勻,2-8℃,≤12000 g離心10-15 min;
3. 取上清,于15-30℃放置5min,加0.2 ml氯仿,劇烈搖動15 sec, 15-30℃放置2-3min,2-80C, ≤12000 g,離心15 min;
4. 取水相,加等體積異丙醇,15-30℃放置10 min,2-8℃,<12000 g,離心10 min;
5. 用75%乙醇洗滌沉淀,2-8℃,<7500g離心5 min;用DEPC處理的水溶解RNA,-20℃短時間保存,或-80℃長期保存。
3. CTAB法提取植物總RNA
1. 50 ml離心管中加入15 ml CTAB提取緩沖液(需加入300ul β-巰基乙醇),65℃預(yù)熱;
2. 稱2-3 g新鮮的植物材料,在液氮中充分研磨成粉末;
3. 樣品轉(zhuǎn)入50 ml離心管中,迅速震蕩混勻至無成團結(jié)塊,65℃溫浴10 min,再加入15 ml氯仿,混勻;
4. 室溫下,10000 rpm,離心15 min,上層水相移入一個新的離心管,加入等體積的氯仿,混勻后再抽提一次;
5. 將上層水相轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入 8M的LiCl,使終濃度為2M(約加入水相的 1/3),4℃,過夜;
6. 4℃,12000 rpm,離心20 min沉淀RNA棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀,晾干;
7. 加入500ul SSTE溶解沉淀,轉(zhuǎn)移至1.5 ml離心管中,加入等體積酸性酚/氯仿后混勻;
8. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,將上層水相轉(zhuǎn)移至另一1.5 ml離心管中,加入等體積的氯仿后混勻;
9. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,上層水相轉(zhuǎn)移至新管中,加入1/10體積的3M NaAC和2倍體積無水乙醇,-80℃靜置30 min;
10. 4℃,13000 rpm,離心20 min,70%乙醇洗滌沉淀,烘干后加入50 ul DEPC處理H20溶解RNA,取1ul電泳檢測,-80℃保存?zhèn)溆谩?
4. RNA的純化
1. DEPC水處理的1.5 ml離心管中加入:45ul RNA,7.5ul l0XDnase Assay Buffer,20U RNase inhibitor 1.5ul Dnase I,混合液于37℃溫浴30 min;
2. 用DEPC-H20將溶液體積調(diào)至250ul,加1/10體積的3 M NaAC(pH 5.2)和2倍體積冷的無水乙醇,混勻,-20℃放置30 min;
3. 4℃,12000 rpm,離心20 min,沉淀RNA;
4. -20℃預(yù)冷的70%乙醇洗一次,-20℃預(yù)冷的100%乙醇洗一次;
5. 干燥后,用20 ul DEPC處理的H2O溶解,-20℃保存。
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