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基因檢測攜手互聯(lián)網(wǎng) 推動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)再進(jìn)步

[2017/12/25]

    2017年12月22日,云健康基因科技(上海)有限公司(以下簡稱:云健康)總裁/CEO金剛博士與阿里云上海分公司(以下簡稱:阿里云)總經(jīng)理張婷華,在上海正式簽署了基因組大數(shù)據(jù)云計(jì)算戰(zhàn)略合作協(xié)議,雙方未來將加快BT(生物技術(shù) )和IT(信息技術(shù))的深度結(jié)合,利用云端優(yōu)化基因大數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、分析、管理等,挖掘和轉(zhuǎn)化云健康已擁有的萬人基因組數(shù)據(jù)。并將借助阿里云存儲(chǔ)和計(jì)算能力,加快云健康承擔(dān)的發(fā)改委10萬人群基因檢測惠民工程的數(shù)據(jù)建設(shè)工作,進(jìn)一步深入揭示中國人群遺傳突變分布,推動(dòng)中國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和大健康產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
 
  目前,基于阿里云的公共云平臺(tái)和強(qiáng)大的技術(shù)實(shí)力, 已完成了云健康的云平臺(tái)搭建, 部署和實(shí)施了數(shù)據(jù)生產(chǎn)系統(tǒng)CHAPM、云健康基因云分析平臺(tái)CHGCloud(該平臺(tái)目前已經(jīng)部署了全基因組、外顯子、轉(zhuǎn)錄組、甲基化、三代測序組裝等數(shù)十個(gè)分析流程)、數(shù)據(jù)分析研發(fā)平臺(tái), 并實(shí)現(xiàn)了云健康上?偛亢湍暇┓止镜10G專線和云端高速互聯(lián)互通。
 
  云健康作為發(fā)改委首批基因檢測示范中心,建立了超高通量全基因組測序技術(shù)平臺(tái)NovaSeq 6000、HiSeq X Ten、PacBio Sequel,承擔(dān)著國家十三五精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)體系建設(shè)、華東人群大隊(duì)列、基因大數(shù)據(jù)等國家級(jí)和上海市重大項(xiàng)目,這將會(huì)產(chǎn)生百萬級(jí)人群的基因大數(shù)據(jù)及健康醫(yī)療信息,這些PB級(jí),甚至ZB級(jí)數(shù)據(jù)的挖掘和應(yīng)用面臨前所未有的挑戰(zhàn)。通過與阿里云的專線直連, 結(jié)合云健康自建的本地計(jì)算和存儲(chǔ)中心, 極大地增強(qiáng)了云健康的存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)分析通量及彈性。此外, 阿里云在全國部署的眾多數(shù)據(jù)中心為云健康的數(shù)據(jù)交付業(yè)務(wù)提升了一個(gè)量級(jí)。通過本地?cái)?shù)據(jù)實(shí)時(shí)上云和自動(dòng)化數(shù)據(jù)生產(chǎn)業(yè)務(wù)的部署,云健康將再次為客戶項(xiàng)目縮短檢測和數(shù)據(jù)交付周期。
 
  此次合作將大力提升云健康大數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和計(jì)算能力,充分發(fā)揮多生產(chǎn)中心的優(yōu)勢,可滿足海量數(shù)據(jù)的吞吐和計(jì)算;擁有專線直通上海超算中心和阿里云,已部署完成的云健康基因云分析平臺(tái)CHGCloud可對(duì)基因組數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)云端上傳、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制和自動(dòng)化數(shù)據(jù)生產(chǎn),可更加快捷、智能地對(duì)海量基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行傳輸和生物信息自動(dòng)化分析,此外依托阿里巴巴多年安全技術(shù)研究積累成果,提供多場景、全方位數(shù)據(jù)安全防護(hù)。
 
  雙方作為國家級(jí)高新技術(shù)企業(yè),此次合作,雙方將建立大健康產(chǎn)業(yè)標(biāo)桿合作,有利于雙方在國家大數(shù)據(jù)戰(zhàn)略和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃中贏得首發(fā)優(yōu)勢。云健康將發(fā)揮全國測序通量保持前列及生物信息大數(shù)據(jù)人才隊(duì)伍一流的優(yōu)勢,大力發(fā)展人群基因檢測服務(wù)和建設(shè)中國人群基因組大數(shù)據(jù)。阿里云將利用其積攢的云計(jì)算、人工智能等先進(jìn)技術(shù)通過云健康的合作共同參與國家醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)戰(zhàn)略研究。