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科學家從人體細菌基因組中發(fā)現(xiàn)兩種新型抗生素
[2016/11/23]
目前使用的大多數(shù)抗生素其實是細菌產生的天然分子。由于細菌耐藥性的不斷增強,醫(yī)學方面迫切需要研發(fā)新的的抗生素。然而,誘導細菌產生新的抗生素是一件棘手的事。大多數(shù)細菌不會在實驗室中生長,就算實驗室中培養(yǎng)出了這些細菌,大多數(shù)的產生抗生素的基因很少表達。近日,洛克菲勒大學(RockefellerUniversity)的研究人員找到了解決問題的新方法。
研究人員發(fā)現(xiàn)殺死抗藥性金黃色葡萄球菌的新抗生素HumimycinA和HumimycinB
研究人員從公共基因數(shù)據(jù)庫中找到存在人體內的細菌基因組,然后使用專門的計算機軟件掃描數(shù)百個特定編譯合成非核糖體肽分子的基因簇,這些非核糖體肽是形成許多抗生素的基礎。最后他們使用軟件來預測基因簇產生的分子化學結構。通過使用計算方法來選出微生物基因組中產生抗生素化合物的基因,然后跳過細菌培養(yǎng)過程直接合成這些化合物本身,用此類方法,他們已經成功找到兩種新型抗生素。
發(fā)掘huminmycin之旅
從軟件最初確定的57個潛在有用的基因簇中,研究人員進一步篩選出了30個基因簇。布蘭迪和他的同事們然后使用一種固相肽合成的方法制造出了25種不同的化合物。
通過測試這些化合物對人類病原體的反應,研究人員成功篩選出了兩種抗生素,他們將其命名為HumimycinA和HumimycinB。兩者都發(fā)現(xiàn)于一種稱為紅球菌屬細菌中,這是傳統(tǒng)細菌培養(yǎng)中從未發(fā)現(xiàn)的新抗生素。
葡萄球菌和鏈球菌是兩大危害人體的細菌,近年來它們對各種抗生素逐漸表現(xiàn)出抗性。實驗表明,humimycins通過抑制細菌細胞壁合成酶來切斷細胞壁合成途徑,細菌當即死亡。因而humimycins對這兩類細菌十分有效。
Humimycins的作用還不止如此。β-內酰胺是一類廣泛應用的處方抗生素,其效果常常隨著細菌出現(xiàn)抗藥性而消失。然而科學家們發(fā)現(xiàn),其中一種humimycins可以用來重新敏化細菌,消除細菌對β-內酰胺的抗藥性。
神奇的協(xié)同作用
在實驗中,他們將具有β-內酰胺抗性的葡萄球菌暴露于與β-內酰胺抗生素和humimycinA的混合物中,發(fā)現(xiàn)細菌立刻死亡。即使HumimycinA含量很少時,相同結果仍然出現(xiàn)。因此布蘭迪猜測兩種抗生素都對中斷細菌生命活動起到了作用。
為了進一步驗證推論,布蘭迪和他的同事們用具有β-內酰胺抗性的金黃色葡萄球菌感染小鼠。他們發(fā)現(xiàn)用含有humimycinA和β-內酰胺抗生素的混合物處理的小鼠的效果遠遠優(yōu)于僅用任何其中一種藥物的小鼠。這給人們治療抗藥性金黃色葡萄球菌提供了一條新思路。
布蘭迪希望這一發(fā)現(xiàn)能夠激發(fā)更多科研團隊挖掘細菌基因組,找到更多的新型抗生素。除此之外,布蘭迪建議大家的眼光可以不用局限在人體微生物的基因組,微生物的基因組是一片巨大的寶藏,等待著人類去開采。
(來源:深科技)