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DNA測(cè)序儀器揭秘稀有生物圈

[2016/1/5]

    在很多地方,科學(xué)家對(duì)土壤中生存著哪些生物或者單獨(dú)有機(jī)體所扮演的新角色幾乎沒(méi)有概念。如今,土壤學(xué)家表示,一套全新的工具能幫助研究人員填補(bǔ)這些空白,包括先進(jìn)的DNA測(cè)序方法能決定一份泥土或水樣本中生活著多少種微生物。    

    生態(tài)學(xué)家和生物保護(hù)學(xué)家深入挖掘泥土的時(shí)候到了——以便更好地了解對(duì)健康生態(tài)系統(tǒng)和人類食物供應(yīng)至關(guān)重要并且可能提供了豐富潛在抗生素資源的土壤生物。    

    這項(xiàng)要求擴(kuò)大了常常被忽略的關(guān)于地下生物多樣性研究的呼吁,被收納進(jìn)一個(gè)為迎接12月5日世界土壤日而推出的論文匯編中!   

    “盡管過(guò)去數(shù)十年取得了顯著進(jìn)展,但目前的土壤生態(tài)學(xué)仍落后于地上生態(tài)學(xué)。我們對(duì)地下世界的了解相對(duì)有限。”德國(guó)柏林自由大學(xué)土壤生態(tài)學(xué)家Stavros Veresoglou在發(fā)表于《自然—通訊》雜志的一篇論文中表示。研究人員表示,尤其是對(duì)土壤生物滅絕風(fēng)險(xiǎn)的研究驚人地匱乏! 

    “我們需要研究土壤中的滅絕現(xiàn)狀,而現(xiàn)在是時(shí)候開(kāi)始了!闭撐墓餐髡、柏林自由大學(xué)土壤微生物學(xué)家Matthias Rillig表示,“考慮到在土地利用和全球氣候變化方面人類正在對(duì)地球所做的事情,土壤學(xué)家普遍擔(dān)心我們可能正錯(cuò)過(guò)一些正在發(fā)生的事情。”    

    論文作者表示,一些研究已記錄了由于物種入侵或氣候條件發(fā)生變化而導(dǎo)致蚯蚓和分解樹(shù)木的真菌出現(xiàn)的地方性滅絕。不過(guò),研究人員很容易低估土壤生物滅絕風(fēng)險(xiǎn),部分原因在于認(rèn)為土壤微生物和其他地下生物在全球廣泛分布的觀點(diǎn)在作祟。在很多地方,科學(xué)家對(duì)土壤中生存著哪些生物或者單獨(dú)有機(jī)體所扮演的新角色幾乎沒(méi)有概念!   

    如今,土壤學(xué)家表示,一套全新的工具能幫助研究人員填補(bǔ)這些空白,包括先進(jìn)的DNA測(cè)序方法能決定一份泥土或水樣本中生活著多少種微生物。比如,一些研究人員正利用此類工具揭秘所謂的稀有生物圈——以很低豐度存留在土壤樣本中的大量多元化微生物!   

    “如果我們能理解稀有生物圈,或許就可以斷定土壤生物是否面臨著滅絕風(fēng)險(xiǎn)!泵绹(guó)加州大學(xué)戴維斯分校微生物學(xué)家Jonathan Eisen表示。不過(guò),一個(gè)挑戰(zhàn)是測(cè)序工具無(wú)法決定探測(cè)到的DNA來(lái)自活的還是死的生物。同時(shí),由于微生物能快速繁殖,它們的數(shù)量會(huì)隨著季節(jié)或天氣而改變。因此,一些東西現(xiàn)在很罕見(jiàn),并不意味著在其他時(shí)候也很罕見(jiàn)。